Struktur Organisasi Pondok Pesantren Darul Arifin Jambi adalah sebagai berikut :
| Mudir | : | Dr. KH. Zainul Arifin, M.Ed, MA |
| Wakil Mudir | : | |
| – Bidang Akademik | : | Muhammad Zaky Allam / Erika Febrianti, S.Pd |
| – Bidang Pengasuhan | : | Indra, S.Hum / Tri Lestari, S.Pd |
| – Bidang Sumber Daya Manusia | : | M. Ikhbal Jaya Putra, S.Pd / Lisa Novita Sari, M.Pd |
| – Litbang dan Kerjasama | : | Muhtarom, SH |
| Sekretaris | : | Mulyadi, MSI |
| Bendahara Umum | : | Miftakul Rohman, S.Pd |
| Kepala MTs | : | Wisnu Ryan, S.Pd, M.Ag |
| Kepala MA | : | Muhammad Syahrun Nizham, S.H, S.Pd |
| Kepala TU | : | Ahmad Nurhamim, M.Pd |
| Operator Madrasah | : | Yudi April Yanto, SH |